喻子牛——贝类遗传育种专家

科学研究：

研究方向：

主要从事贝类遗传学与育种学、分子生物学与基因组学、分子系统学研究。

承担科研项目情况：

先后主持和参与了多项国家和省部级科研项目，包括863课题、973课题、国家自然科学基金课题及重点课题、国家公益性农业专项、国家现代农业技术体系建设专项、中国科学院知识创新重要方向性项目、创新团队国际合作伙伴计划项目、教育部留学回国人员项目、教育部高等学校骨干教师资助项目、山东省自然科学基金课题、广东省自然科学基金重点课题等。

1．国家973计划课题：贝类抗病和抗逆的关键基因及其网络调控机制，2010-14。

2．院知识创新工程重要方向项目子课题：牡蛎养殖生产与初级生产力的关系，2009-11。

3．国家公益性行业专项：贝类良种选育体系建设，2008-10。

4．国家现代农业技术体系建设专项：国家贝类产业技术研发中心，2008-12。

5．国家海洋生物技术863项目：香港巨牡蛎优质、高产、抗逆品种的培育，2006-10。

6．中国科学院资助项目：中国科学院“百人计划”入选者研究课题，2005-08。

7．国家自然科学基金项目：太平洋牡蛎多态EST标记开发及其基因组作图研究，2006-08。

8．国家自然科学基金项目：华贵栉孔扇贝微卫星分子标记开发及连锁图构建，2008-10。

9．广东省自然科学基金重点课题：近江牡蛎基因组和EST微卫星标记开发及连锁图构建，2009-11。

10．广东省科技计划项目：近江牡蛎高生长率品种的良种选育及应用示范，2008-10。

科研成果：

1．太平洋牡蛎和近江牡蛎多态EST标记的开发及其基因组作图研究 喻子牛; 吴相云; 马海涛; 张扬; 夏建军; 肖述; 何小翠; 王艳红; 付定坤; 徐晓东; 李路; 李军; 孔晓瑜【科技成果】中国科学院南海海洋研究所 2009-04-01

2．太平洋牡蛎和近江牡蛎多态EST标记的开发及其基因组作图研究 喻子牛; 吴相云; 马海涛; 张扬; 夏建军; 肖述; 何小翠; 王艳红; 付定坤; 徐晓东; 李路; 李军; 孔晓瑜【科技成果】中国科学院南海海洋研究所 2009-04-01

3．珍珠贝和牡蛎优质、高产、抗逆品种的培育何毛贤; 李琪; 石耀华; 喻子牛; 田传远; 胡建兴; 夏建军; 管云雁; 郑小东; 孔晓瑜; 吴相云【科技成果】中国科学院南海海洋研究所; 中国海洋大学; 海南大学 2010-10-01

4．珍珠贝和牡蛎优质、高产、抗逆品种的培育何毛贤; 李琪; 石耀华; 喻子牛; 田传远; 胡建兴; 夏建军; 管云雁; 郑小东; 孔晓瑜; 吴相云【科技成果】中国科学院南海海洋研究所; 中国海洋大学; 海南大学 2010-10-01

发明专利：

1．华贵栉孔扇贝微卫星标记的构建方法王艳红; 喻子牛 【中国专利】中国科学院南海海洋研究所 2007-09-26

2．太平洋牡蛎EST微卫星标记的筛选方法 喻子牛; 王艳红【中国专利】中国科学院南海海洋研究所 2007-10-24

3．华南沿海七种巨蛎属牡蛎的PCR-RFLP鉴别方法 喻子牛; 夏建军【中国专利】中国科学院南海海洋研究所 2008-02-27

论文专著：

在国内外学术期刊发表论文60余篇，其中SCI收录论文30多篇。

出版专著：

资料更新中……

发表英文论文：

1. Fu, D., Y. Zhang, S. Xiao and Z. Yu*, 2011,The first homolog of a TRAF7 (TNF receptor-associated factor 7) gene in a mollusk, Crassostrea hongkongensis. Fish Shellfish Immunol. 31: 1208-1210.

2. Li, L., Xiao S. and Z. Yu*, 2011, Development of twenty-six microsatellite loci from Crassostrea hongkongensis and cross-species amplification in two closely related species. J Genetics 90 (2): e58-61.

3. Yu Z.*, X. He, F. Yu and Y. Zhang, 2011, Two superoxide dismutase (SOD) with different subcellular localizations involved in innate immunity in Crassostrea hongkongensis.Fish Shellfish Immunol. 31: 533-539.

4. Chen J, Xiao S, Z. Yu*, 2011, Cloning of the microsomal glutathione S-transferase 3 (MGST3) gene and expression analysis in pearl oyster Pinctada martensii. Fish Shellfish Immunol. 31: 823-830.

5. Chen, J., Xiao S., Z. Yu*, 2011, Molecular cloning, characterization and expression analysis of receptor for activated C kinase 1 (RACK1) from pearl oyster (Pinctada martensii) challenged with bacteria and exposed to cadmium. Fish Shellfish Immunol. 31: 781-787.

6. Zhang, Y., D. Fu, F. Yu, Q. Liu, Z. Yu*, 2011, Two homologues of catalase genes are involved in host protection against bacterial infection and oxidative stress in Crassostrea hongkongensis. Fish Shellfish Immunol. 31:894-903.

7. He, X., Y. Zhang, F. Yu, Z. Yu*, 2011, A novel sialic acid binding lectin from Hong Kong oyster (Crassostrea hongkongensis) with anti-bacterial activity. Fish Shellfish Immunol. 31:1247-1250.

8. Fu, D., J. Chen, Y. Zhang, Z. Yu*, 2011, Cloning and expression of a heat shock protein (HSP) 90 gene in the haemocytes of Crassostrea hongkongensis under osmotic stress and bacterial challenge. Fish Shellfish Immunol. 31: 118-125.

9. Zhang, Y., X. He, Z. Yu*, 2011, Two homologues of inhibitor of NF-kappa B (IκB) are involved in the immune defense of the Pacific oyster, Crassostrea gigas. Fish Shellfish Immunol 30: 1354-1361.

10. He, X., Y. Zhang, Z. Yu*, 2011, An Mpeg (Macrophage expressed gene) from the Pacific oyster Crassostrea gigas: molecular characterization and gene expression. Fish Shellfish Immunol. 30:870-876.

11. Zhang, Y., X. He, X. Li, D. Fu, Chen, J., Z. Yu*, 2011, The second bactericidal permeability increasing protein (BPI) and its revelation of the gene duplication in the Pacific oyster, Crassostrea gigas. Fish Shellfish Immunol. 30:954-963.

12. Chen, J., Xiao S., Z. Yu*, 2011, F-type lectin involved in defense against bacterial infection in the pearl oyster (Pinctada martensii). Fish Shellfish Immunol. 30: 750-754.

13. Fu, D., Y. Zhang, Z. Yu*, 2011, Cloning and expression analysis of an ubiquitin gene (UbL40) in the haemocytes of Crassostrea hongkongensis under bacterial challenge. Chinese J. Oceano. Limno. 29 (1):80-86.

14. He, X., Y. Zhang, X. Wu; S. Xiao; and Z. Yu*, 2011, Cloning and characterization of two ferritin subunit genes from bay scallop, Argopecten irradians (Lamarck 1819). Mol. Biol. Rep. 38: 2125-2132.

15. Xu, X., X. Wu, Z. Yu*, 2010, The mitogenome of Paphia euglypta (Bivalvia: Veneridae) and comparative mitogenomic analyses of three venerids. Genome 53 (12): 1041–1052.

16. Xiao, S., H. Ma, Z. Yu, 2011, Development of 20 novel microsatellite markers in the Hong Kong oyster, Crassostrea hongkongensis. Conserv. Genet. Res. 3:413-415.

17. Li, L. and Z. Yu*, 2010, Isolation and characterization of twenty-four microsatellite loci in oyster Crassostrea hongkongensis. Conserv. Genet. Res. 2:93–96.

18. Wu, X., X. Xu, Z. Yu*, X. Kong, Z. Wei, J. Xia, 2010, Comparison of seven Crassostrea mitogenomes and phylogenetic analyses. Mol. Phylogenet. Evol. 57: 448–454.

19. Yu, Z*., Y. Wang and D. Fu, 2010, Development of Fifty-one novel EST-SSR loci in the Pacific oyster, Crassostrea gigas by data mining from the public EST database.Conserv. Genet. Res. 2:13–18.

20. He, X., Y. Zhang and Z. Yu*, 2010, In silico cloning, expression of Rieske-like apoprotein gene and protein subcellular localization in the Pacific oyster, Crassostrea gigas. Mol. Biol. Rep. 37:3259–3264.

21. Kong, X., X. Dong, Y. Zhang, W. Shi, Z. Wang and Z. Yu, 2009, A novel rearrangement in the mitochondrial genome of tongue sole, Cynoglossus semilaevis: control region translocation and a tRNA gene inversion.Genome 52: 975-984.

22. Ma, H. and Z. Yu*, 2009, Isolation and characterization of twenty-three microsatellite loci in the noble scallop, Chlamys nobilis.Conserv. Genet. Res. 1: 131-134.

23. Wu, X, X. Xu, Z. Yu*, J. Xia and X. Kong, 2009. Comparative mitogenomic analyses of three scallops (Bivalvia: Pectinidae) reveal high level variation of genomic organization and a diversity of transfer RNA gene sets. BMC Res. Note 2, 69: 7 pp.

24. Li, Y., X. Kong, Z. Yu et al., 2009, Genetic diversity and historical demography of Chinese shrimp Feneropenaeus chinensis in Yellow Sea and Bohai Sea based on mitochondrial DNA analysis. Afr. J. Biotechnol. 8 (7): 1193-1202.

25. Wang, Y., Z. Yu* and Z. Liu, 2009, Isolation and characterization of twelve microsatellite loci in the noble scallop, Chlamys nobilis. Aquac. Res. 40: 744-747.

26. Ma, H. and Z. Yu*, 2009, Development of twenty-two polymorphic microsatellite loci in the noble scallop, Chlamys nobilis. Conserv. Genet. 10: 1587-1590.

27. Xia, J. X. He and Z. Yu*, 2009, Isolation and characterization of fourteen novel microsatellite loci in the Hong Kong oyster, Crassostrea hongkongensis Conserv. Genet. 10: 1829-1832.

28. Xia, J. and Z. Yu*, 2009, Identification of seven Crassostrea oysters from the South China Sea using PCR- RFLP analysis. J. Mollus. Stud. 75: 139-146.

29. Yu, Z., Z. Wei, X. Kong, W. Shi, 2008, Complete mitochondrial DNA sequence of oyster Crassostrea hongkongensis - a case of “Tandem duplication -random loss” for genome rearrangement in Crassostrea?BMC Genomics 9, 477: 13 pp.

30. Wang, Y., R. Ren and Z. Yu*, 2008, Bioinformatic mining of EST-SSR loci in the Pacific oyster, Crassostrea gigas. Anim. Genet. 39: 287-289. 31. Yu, Z.*, X. Kong, X. Wei, 2007, Application of the first internal transcribed spacer (ITS-1) of ribosomal DNA as a molecular marker to population analysis in Zhikong scallop, Chlamys farreri. Acta Oceanol. Sinica. 26: 93-100.

32. Kong, X., J. Yu, Z. Yu* et al., 2007, Comparative analysis of 5’-end sequence of mitochondrial control region of six flatfish species (Pleuronectidae) from the Yellow Sea and phylogentic analysis of Pleuronectiformes. Raffles Bull. Zool. Suppl. 14: 111-120.

33. Yu, Z. and X. Guo, 2006, Identification and mapping of disease-resistance QTLs in the Eastern oyster, Crassostrea virginica Gmelin. Aquaculture 54:160-170.

34. Yu, Z., Kong, X., Y. Jiang et al., 2005, Mitochondrial DNA sequence variation of Japanese anchovy (Engraulis japonicus) from the Yellow Sea and East China Sea. Fish. Sci. 71: 299-307.

35. Zhang, L., X. Kong, Z. Yu* et al., 2004, A survey of genetic changes and search for sex-specific markers by AFLP and SAMPL in a breeding program of Chinese shrimp (Penaeus chinensis).J. Shellfish Res. 23: 897-902.

36. Lapègue, S., F. M. Batista, S. Heurtebise, Z. Yu and P. Boudry, 2004, Evidence for the presence of the Portuguese oyster, C. angulata, in Northern China. J. Shellfish Res. 23: 759-764.

37. Yu, Z. and X. Guo, 2004, Genetic analysis of selected strains of the Eastern oyster (Crassostrea virginica Gmelin) using AFLP and microsatellite markers. Mar. Biotechnol. 6:575-586.

38. Yu, Z. and X. Guo, 2003, Genetic linkage map of the Eastern oyster, Crassostrea virginica Gmelin. Biol. Bull. 204: 327-338.

39. Yu, Z.*, X. Kong, L. Zhang, X. Guo and J. Xiang, 2003, Taxonomic status of four Crassostrea oysters from China as inferred from mitochondrial DNA sequences. J. Shellfish Res. 22: 31-38.

40. Kong, X., Z. Yu*, Y. Liu and L. Chen, 2003, Intraspecific genetic variation in mitochondrial 16S ribosomal gene of Zhikong scallop Chlamys farreri. J. Shellfish Res. 22: 655-660.

发表中文论文：

1 牡蛎盐度胁迫相关基因的初步筛选、克隆及其功能分析付定坤; 何小翠; 张扬; 喻子牛 中国科学院海洋生物资源可持续利用重点实验室; 中国科学院南海海洋研究所【会议】中国动物学会、中国海洋湖沼学会贝类学会分会第十四次学会研讨会论文摘要汇编 2009-11-08

2 真曲巴菲蛤(Paphia euglypta)线粒体基因组全序列测定及比较基因组学研究徐晓东; 吴相云; 喻子牛 中国科学院海洋生物资源可持续利用重点实验室中国科学院南海海洋研究所【会议】中国动物学会、中国海洋湖沼学会贝类学会分会第十四次学会研讨会论文摘要汇编 2009-11-08

3 栉孔扇贝(Chlamys farreri)核糖体转录间隔区ITS-1序列多态性及其在遗传变异研究中的可行性分析魏晓华; 孔晓瑜; 喻子牛 中国海洋大学教育部海水养殖重点实验室; 中国科学院南海海洋研究所应用海洋生物学实验室【会议】中国海洋湖沼学会中国动物学会贝类学分会第十二次学术讨论会摘要 2005-09-01

4 南中国海沿海地区牡蛎养殖：现状与问题 喻子牛 中国科学院海洋生物资源可持续利用实验室中国科学院南海海洋研究所【会议】中国动物学会、中国海洋湖沼学会贝类学分会第八次会员代表大会暨第十三次全国贝类学术讨论会论文摘要集 2007-10-01

5 太平洋牡蛎(Crassostrea gigas)的EST-SSR标记开发王艳红; 任睿; 喻子牛 中国科学院海洋生物资源可持续利用实验室中国科学院南海海洋研究所; 中国科学院海洋生物资源可持续利用实验室中国科学院南海海洋研究所【会议】中国动物学会、中国海洋湖沼学会贝类学分会第八次会员代表大会暨第十三次全国贝类学术讨论会论文摘要集 2007-10-01

6 近江牡蛎(Crassostrea hongkongensis)家系早期发育生长比较陈子桂; 肖述; 潘英; 喻子牛 广西大学; 中国科学院南海海洋研究所【期刊】南方水产科学 2011-12-05

7 丛生盔形珊瑚的2种颜色群体共生藻组成比较周国伟; 黄晖; 喻子牛; 尤丰; 李秀保中国科学院南海海洋研究所海洋生物资源可持续利用重点实验室; 中国科学院海南热带海洋生物实验站; 中国科学院研究生院【期刊】热带海洋学报 2011-03-15

8 香港巨牡蛎雌雄群体的数量性状通径分析肖述; 符政君; 喻子牛 中国科学院海洋生物资源可持续利用重点实验室; 广东省应用海洋生物学重点实验室; 中国科学院南海海洋研究所【期刊】南方水产科学 2011-08-05

9 基于COI序列的翡翠股贻贝Perna viridis线粒体遗传特性分析及其近缘种间的系统关系探讨位正鹏; 孔晓瑜; 吴相云; 喻子牛 中国海洋大学教育部海水养殖重点实验室; 中国科学院南海海洋研究所中国科学院海洋生物资源可持续利用重点实验室【期刊】热带海洋学报 2009-11-15

10 马氏珠母贝4个壳色选育系F_1遗传结构的AFLP分析代悦; 喻子牛; 赵晓霞; 王庆恒; 杜晓东; 吴燕忠广东海洋大学水产学院; 中国科学院南海海洋研究所海洋生物资源可持续利用重点实验室【期刊】基因组学与应用生物学 2010-04-28

11 单核苷酸多态性及其在海洋动物遗传研究中的应用李军; 喻子牛 中国科学院南海海洋研究所中国科学院海洋生物资源可持续利用重点实验室广东省应用海洋生物学重点实验室; 中国科学院研究生院【期刊】南方水产 2010-06-05

12 造礁石珊瑚与其共生藻(Symbiodinium)共生研究进展周国伟; 黄晖; 喻子牛; 董志军; 李元超中国科学院南海海洋研究所海洋生物资源可持续利用重点实验室; 中国科学院海南热带海洋生物实验站; 中国科学院研究生院【期刊】生态学报 2009-08-15

13 十足目染色体研究进展王青; 孔晓瑜; 于珊珊; 喻子牛 中国海洋大学国家教育部海水养殖研究重点实验室; 中国科学院南海海洋研究所; 广东广州; 山东青岛【期刊】海洋科学 2005-06-09

14 栉孔扇贝(Chlamys farreri)自然群体遗传多样性的RAPD分析刘亚军; 孔晓瑜; 喻子牛 中国海洋大学水产学院教育部海水养殖研究重点实验室; 中国科学院南海海洋研究所青岛【期刊】海洋与湖沼 2006-07-30

15 6种舌鳎亚科鱼类ITS1序列长度多态性及系统分析徐晖; 李军; 孔晓瑜; 肖志忠; 李玉龙; 张艳春; 时伟; 位正鹏; 喻子牛 中国海洋大学海水养殖教育部重点实验室; 中国科学院海洋研究所; 中国科学院南海海洋研究所; 中国科学院南海海洋研究所青岛【期刊】海洋与湖沼 2008-01-30

16 养殖牡蛎的选择育种研究与实践肖述; 喻子牛 中国科学院南海海洋研究所; 中国科学院南海海洋研究所中国科学院海洋生物资源可持续利用重点实验室; 广东省应用海洋生物学重点实验室; 广东广州; 中国科学院海洋生物资源可持续利用重点实验室【期刊】水产学报 2008-03-15