论文专著:
出版专著:
[1] 邱德有、朱澂编著,《抗癌药物紫杉醇》,北京:北京大学出版社,1996。
[2] 黄璐琦主编,邱德有、梁宗锁、陈敏副主编,《丹参大全-丹参植物学研究》, 北京:人民卫生出版社,2008。
[3] 黄璐琦主编《分子生药学》(第二版), 编委,北京:北京大学医学出版社,2006。
[4] 高文远、贾伟主编、黄璐琦、邱德有副主编,《药用植物克隆培养及工业化生产》, 北京:化学工业出版社,2005。
发表英文论文:
[1] Fenjuan Shao, Qiang Lu, Iain W. Wilson, and Deyou Qiu. Genome-wide identification and characterization of the SPL gene family in Ziziphus jujuba. Gene, 2017, 627:315-21.
[2] Fenjuan Shao, Qian Zhang, Hongwei Liu, Shanfa Lu, Deyou Qiu. Genome-wide identification and analysis of microRNAs involved in witches'-broom phytoplasma response in Ziziphus jujuba,PLOS ONE, 2016, 11(11): e0166099
[3] Zhang Q#, Liu H#, Sun G, Wilson IW, Wu J, Hoffman A, Cheng J, Qiu D*.Baseline survey of root-associated microbes of Taxus chinensis (Pilger) Rehd. PloS one, 2015, 10(3): e0123026
[4] Shao F, Qiu D, Lu S*. Comparative analysis of the Dicer-like gene family reveals loss of miR162 target site in SmDCL1 from Salvia miltiorrhiza. Scientific Reports,2015, 5: 09891
[5] Yang Yanfang, Zhao Hainan, Roberto A Barrero, Zhang Baohong, Sun Guiling, Wilson Iain W, Xie Fuliang, Walker Kevin D, Parks Joshua W, Bruce Robert, Guo Guangwu, Chen Li, Zhang Yong, Huang Xin, Tang Qi, Liu Hongwei, Bellgard Matthew I, Qiu Deyou*, Lai Jinsheng*, Hoffman Angela*. Genome sequencing and analysis of the paclitaxel-producing endophytic fungus Penicillium aurantiogriseum NRRL 62431. BMC Genomics, 2014, 15: 1-14.(* 通讯作者)
[6] Zhang Nan, Han Zhentai, Sun Guiling, Hoffman Angela, Wilson Iain W, Yang Yanfang, Gao Qian, Wu Jianqiang, Xie Dan, Dai Jungui, Qiu Deyou*. Molecular cloning and characterization of a cytochrome P450 taxoid 9á-hydroxylase in Ginkgo biloba cells. BBRC, 2014, 443: 938-943.(* 通讯作者)
[7] Guo Q, Ma X*, Wei S, Qiu D, Iain W, Wu P, Tang Q, Liu L, Dong S, Zu W*. De novo transcriptome sequencing and digital gene expression analysis predict biosynthetic pathway of rhynchophylline and isorhynchophylline from Uncaria rhynchophylla, a non-model plant with potent anti-alzheimer‟s properties. BMC Genomics, 2014, 15: 676
[8] Sun Guiling, Yang Yanfang ?, Xie Fuliang, Wen Jianfan, Wu Jianqiang, Wilson Iain W, Tang Qi, Liu Hongwei, Qiu Deyou*. Deep sequencing reveals transcriptome re-programming of Taxus × media cells to the elicitation with methyl jasmonate. PLoS One, 2013, 8(4):e62865 (?共同第一作者).(* 通讯作者)
[9] Xie Fuliang, Burklew Caitlin E, Yang Yanfang, Liu Min, Xiao Peng, Zhang Baohong*, Qiu Deyou*. De novo sequencing and a comprehensive analysis of purple sweet potato (Impomoea batatas L.) transcriptome. Planta, 2012,236(1): 101-113.(* 通讯作者)
[10] Tang Qi, Su Zhiheng, Ma Xiaojun, Xu Derong, Liang Yanhai, Cao Haibo, Wang Xuesong, Qu Xiaoying, Hoffman Angela*, Liu Honhwei, Gu Dizhou, Qiu Deyou*. LC-MS method for detecting prostratin in plant extracts and identification of a high-yielding population of Euphorbia fischeriana. Phytochemistry Letters, 2012, 5(1): 214: 218.(* 通讯作者)
[11] Tang Qi, Ma Xiaojun*, Mo Changming, Wilson Iain W, Song Cai, Zhao Huan, Yang Yanfang, Fu Wei, Qiu Deyou*. An efficient approach to finding Siraitia grosvenorii triterpene biosynthetic genes by RNA-seq and digital gene expression analysis. BMC Genomics, 2011, 12: 343.(* 通讯作者)
[12] Roberto A Barrero, Chapman B, Yang Yanfang, Moolhuijzen P, Keeble-Gagnère G, Zhang Nan, Tang Qi, Bellgard Matthew I*, Qiu Deyou*. De novo assembly of Euphorbia fischeriana root transcriptome identifies prostratin pathway related genes. BMC Genomics, 2011, 12: 600.(* 通讯作者)
[13] Wang Qiong, Chen Jienan*, Zhang Huaiyun, Lu Mengzhu, Qiu Deyou, Wen Yafeng, Kong Qianqian. Synthesis of Water Soluble Quantum Dots for Monitoring Carrier-DNA Nanoparticles in Plant Cells. Journal of Nanoscience and Nanotechnology, 2011, 11(3): 2208-2214(7). (* 通讯作者)
[14] Li Fenglan, Ma Xiaojun, Hu Xinling, Hoffman Angela, Dai Jungui, Qiu Deyou*. Antisense-induced suppression of taxoid 14β-hydroxylase gene expression in transgenic Taxus × media cells. Journal of African Biotechnology, 2011, 10: 8720-8728.(* 通讯作者)
[15]Qiu Deyou*, Pan Xiaoping, Wilson Iain W*, Li Fenglan, Liu Min, Teng Wenjing, Zhang Baohong*. High throughput sequencing technology reveals that the taxoid elicitor methyl jasmonate regulates microRNA expression in Chinese yew (Taxus chinensis). Gene, 2009, 436(1-2):37-44.(* 通讯作者)
[16] Qiu Deyou, Wilson Iain W, Gan Siming, Washusen Russell, Moran Gavin F, Southerton Simon G*. Gene expression in Eucalyptus branch wood with marked variation in cellulose microfibril orientation and lacking G-layers. New Phytologist, 2008, 179: 94-103(* 通讯作者).
[17] Spokevicius Antanas V, Southerton Simon G, MacMillan Colleen P, Qiu Deyou, Gan Siming, Tibbits Josquin FG, Moran Gavin F, Bossinger Gerd*. β-tubulin controls cellulose microfibril orientation in plant secondary fibre cell walls. The Plant Journal, 2007, 51(4): 717-726(* 通讯作者).
[18] Ketchum Raymond EB, Horiguchi Tohru, Qiu Deyou, Williams Robert M, Croteau Rodeny B*. Administering cultured Taxus cells with early precursors reveals bifurcations in the taxoid biosynthetic pathway. Phytochemistry, 2007, 68(3):335-341(* 通讯作者).
[19] Ketchum Raymond EB, Rithner Christopher D, Qiu Deyou, Kim Yousun, Williams Robert M, Croteau Rodeny*. Taxus metabolomics: methyl jasmonate preferentially induces taxoids oxygenated at C-13 in Taxus × media cell cultures. Phytochemistry, 2003, 62:901-909(* 通讯作者).
[20] Wang Lida, Qiu Deyou, Chen Jiyun, Han Yifan, Zheng Junhua, Guo De-an*. Callus cultures of Annona squamosa for the production of annonaceous acetogenins. Journal of Asian Natural Products Research, 2002, 4 (3):171-174(* 通讯作者).
[21] Moran G. F.,Thamarus K.A., Raymond C.A., Qiu D.Y.,Uren T., Southerton S.G.,2002, Genomics of Eucalyptus wood traits. Annals of Forest Science,59(5):645-649.
[22] Zhang Junzeng, Zhang Lihe, Wang Xihong, Qiu Deyou, Sun Dian, Gu Jianqiao, Fang Qicheng*. Microbial transformation of 10-deacetyl-7-epitaxol and 1β-hydroxybaccatin I by some fungi from the inner bark of Taxus yunnanensis, Journal of Natural Products, 1998, 61: 497-500.(* 通讯作者).
[23] Zhang Junzeng, Tu Fu, Zhang Lihe*, Qiu Deyou. The Epimerization of 10-Deacetylbaccatin Ⅲ by Microsphaeropsis Onychiuri a Fungus from Taxus Yunnanensis. Chinese Chemical Letters, 1997, 8(1): 47-48(* 通讯作者).
[24] Qiu D Y.,Zhou W.Y.,1995,Identification of homozygotes deived from anthers of asparagus(Asparagus officianalis L.), Acta Horticulture, 402:398-402.
发表中文期刊论文:
[1]丰美静,张恺恺,黄中文,邱德有,陈段芬,杨艳芳.东北红豆杉温室扦插繁殖试验[J].北方园艺,2020(13):65-70.
[2]蒋路园,王旭,张恺恺,陈段芬,邱德有,杨艳芳.红豆杉TcERF基因qRT-PCR体系构建与优化[J].农业生物技术学报,2020,28(06):1096-1104.
[3]张恺恺,吕星,杨立莹,陈段芬,邱德有,杨艳芳.红豆杉TbAP2基因荧光定量PCR体系的建立及优化[J].林业科学研究,2019,32(01):39-46.
[4]张恺恺,李清,惠楠,陈段芬,邱德有,杨艳芳.红豆杉总RNA提取方法的比较[J].分子植物育种,2019,17(18):5993-5999.
[5]芦强,邵芬娟,邱德有.毛果杨LBD基因家族的全基因组分析[J].基因组学与应用生物学,2018,37(01):313-325.
[6]芦强,邵芬娟,邱德有.雷蒙德氏棉LBD基因家族的鉴定及进化表达分析[J].分子植物育种,2017,15(11):4308-4324.
[7]杨艳芳,刘洪伟,邱德有.基于高通量测序的瑞香狼毒转录组数据分析[J].中草药,2017,48(22):4740-4747.
[8]王帅,邵芬娟,李论,芦强,邱德有.穗花杉的转录组测序及其转录组特性分析[J].林业科学研究,2017,30(05):759-764.
[9]刘洪伟,王帅,王强,王伟,杨艳芳,刘锡葵,邱德有.甜菜树贝壳杉烯合酶基因的克隆与原核表达[J].食品与生物技术学报,2017,36(05):479-485.
[10]王帅,赵中槐,董清华,邵芬娟,芦强,邱德有.香榧中不存在紫杉醇的化学及分子生物学证据[J].基因组学与应用生物学,2016,35(11):3172-3177.
[11]刘洪伟,杨艳芳,熊王丹,吴平治,吴国江,邱德有.不同植物中推定蓖麻烯合酶基因的生物信息学分析[J].植物研究,2016,36(04):605-612.
[12]刘洪伟,杨艳芳,李艳艳,王帅,邱德有.榛子产紫杉醇内生真菌Penicillium aurantiogriseum中GGPP合酶基因的克隆与表达[J].广西植物,2016,36(04):456-461+506.
[13]王帅,邵芬娟,李论,芦强,邱德有.穗花杉中不存在紫杉醇的化学及分子生物学证据[J].西北植物学报,2016,36(04):661-666.
[14]程俊文,贺亮,邹景泉,方茹,邱德有,胡传久,魏海龙,蒋云鹤,王衍彬.响应面法优化内生真菌发酵产紫杉醇工艺[J].浙江林业科技,2015,35(06):68-72.
[15]李艳艳,杨艳芳,王俊青,王帅,刘洪伟,邱德有.红豆杉TcLBDs基因的克隆与表达分析[J].林业科学,2015,51(10):126-133.
[16]李艳艳,杨艳芳,刘洪伟,王帅,邱德有.中国红豆杉TcAPLs基因的克隆及表达分析[J].中草药,2015,46(10):1512-1519.
[17]邱德有,张彬,杨艳芳,邵芬娟,滕文静.紫杉醇生物合成研究历史、现状及展望[J].生物技术通报,2015,31(04):56-64.
[18]周华,朱祺,杨艳芳,刘洪伟,余发新,邱德有.南方红豆杉bHLH基因克隆与序列分析[J].植物研究,2015,35(01):52-59.
[19]杨艳芳,刘洪伟,邱德有.欧洲红豆杉AP2/ERF转录因子基因序列分析[J].氨基酸和生物资源,2014,36(04):54-59.
[20]周华,朱祺,杨艳芳,余发新,邱德有.红豆杉分子生物学研究进展[J].植物生理学报,2014,50(04):373-381.
[21]张楠,孙桂玲,戴均贵,杨艳芳,刘洪伟,邱德有.银杏细胞转录组高通量测序及分析[J].中国生物工程杂志,2013,33(05):112-119.
[22]曹秀萍,邹建华,邱德有,戴均贵.虎眼万年青属植物Ornithogalum thyrsoide的甾体皂苷及黄酮类化学成分[J].天然产物研究与开发,2012,24(06):768-771.
[23]刘洪伟,唐其,杨艳芳,张楠,邱德有.从狼毒大戟中克隆蓖麻烯合成酶基因[J].分子植物育种,2012,10(01):62-66. 通讯作者
[24]顾地周,杨丽娟,冯颖,姜云天,高捍东,邱德有.延缓生长法在试管内保存牛皮杜鹃种质初探[J].科技通报,2011,27(04):546-548+590.
[25]唐其,邱德有,马小军,莫长明,付伟.罗汉果果实不同发育时期SSH文库的构建[J].广西植物,2011,31(03):388-392.
[26]顾地周,高捍东,邱德有.延缓生长法保存长白山珍稀植物玫瑰种质初探[J].中南林业科技大学学报,2010,30(07):91-93+104.
[27]顾地周,高捍东,邱德有.应用“促成休眠”法试管内保存东北刺人参种质[J].东北林业大学学报,2010,38(03):126-127.
[28]许德荣,唐其,梁延海,曹海波,王雪松,赵厚坤,李云龙,刘光,刘官久,邱德有.狼毒大戟cDNA文库构建及EST测序[J].分子植物育种,2010,8(01):139-144. 通讯作者
[29]邱德有,吴小红,黄璐琦.木本药用植物红豆杉研究的新进展[J].林业科学研究,2009,22(03):439-445.
[30]李凤岚,邱德有,马小军,刘敏,许德荣.利用RNAi抑制曼地亚红豆杉细胞紫杉烷14β-羟基化酶基因的表达[J].中国生物工程杂志,2009,29(05):55-60. 通讯作者
[31]刘敏,滕文静,董清华,晁慧娟,李凤岚,邱德有.草莓果实外源基因瞬时表达系统的建立[J].果树学报,2009,26(01):60-65+130. 通讯作者
[32]吕冬梅,袁媛,黄璐琦,梁日欣,邱德有.丹参毛状根不同培养时期有效成分的积累研究[J].中国中药杂志,2008(09):1078-1080.
[33]吕冬梅,袁媛,张东,黄璐琦,梁日欣,邱德有.丹参毛状根化学成分稳定性研究[J].中国中药杂志,2008(06):653-656.
[34]滕文静,胡新玲,王伟,程克棣,邱德有.紫杉烷13α-羟基化酶基因的克隆及其转化烟草的研究[J].中国生物工程杂志,2008(02):53-58. 通讯作者
[35]金晓磊,沈元月,胡新玲,滕文静,董清华,邱德有.草莓基因工程研究进展[J].果树学报,2007(04):506-512. 通讯作者
[36]崔光红,黄璐琦,邱德有,袁媛,付桂芳.丹参功能基因组学研究Ⅱ——丹参毛状根不同时期基因表达谱分析[J].中国中药杂志,2007,32(13):1267-1272. 通讯作者
[37]崔光红,黄璐琦,唐晓晶,邱德有,王学勇,付桂芳.丹参功能基因组学研究Ⅰ——cDNA芯片的构建[J].中国中药杂志,2007,32(12):1137-1141. 通讯作者
[38]王学勇,崔光红,黄璐琦,邱德有.诱导子对丹参毛状根中丹参酮类成分积累影响[J].中国中药杂志,2007,32(10):976-978. 通讯作者
[39]毛莹,崔光红,黄璐琦,邱德有,刘娟.铜、锌离子影响丹参金属硫蛋白MT2基因表达[J].分子植物育种,2007,5(03):389-392. 通讯作者
[40]王学勇,崔光红,黄璐琦,邱德有.茉莉酸甲酯对丹参毛状根中丹参酮类成分积累和释放的影响[J].中国中药杂志,2007,32(04):300-302. 通讯作者
[41]黄新,邱德有,黄璐琦.茉莉酸甲酯对中国红豆杉细胞基因表达的mRNA差异显示研究[J].分子植物育种,2006(05):627-632.
[42]胡新玲,徐妙云,刘德虎,邱德有.紫杉烷14β-羟基化酶基因片段的克隆及其植物表达载体的构建[J].分子植物育种,2006(02):243-250.
[43]邱德有,宋经元,马小军,祁建军,张荫麟.丹参毛状根生物反应器大规模培养的研究[J].分子植物育种,2004,2(05):699-703.
[44]邱德有,黄璐琦.代谢组学研究——功能基因组学研究的重要组成部分[J].分子植物育种,2004,2(02):165-177.
[45]黄新,黄璐琦,邱德有.紫杉醇生物合成途径中相关酶的研究进展[J].中国生物工程杂志,2002,22(05):27-33.
[46]邱德有,吴小红,黄璐琦.现代生命科学技术对中医药发展的影响[J].世界科学技术,2001(02):12-16+63-64.
[47]邱德有.试论药用植物有效成分基因调控的研究进展[J].世界科学技术,2000,2(03):30-34.
[48]邱德有,朱蔚华,吴蕴祺,张大勇,胡秋.利用茉莉酸类结合mRNA差示技术研究紫杉醇生物合成机制[J].中国新药杂志,2000(04):224-228.
[49]胡新生,韩一凡,邱德有.树木木质素含量的遗传变异研究进展[J].林业科学研究,1999,12(6):563-571
[50]李明亮,韩一凡,邱德有,李凝,田颖川.ACC合酶cDNA克隆及其对美洲黑杨体内乙烯产生的反义抑制[J].林业科学,1999(03):3-5.
[51]邱德有,李如玉.紫杉醇生物合成的研究进展[J].生命科学,1998,6:316-320.
[52]邱德有,李如玉,李铃.红豆杉及南方红豆杉体细胞胚胎发生的研究[J].林业科学,1998,34(6):50-54.
[53]邱德有,李如玉,韩一凡.东北红豆杉细胞克隆技术的研究[J].中国中药杂志,1998,23(5):265-267.
[54]邱德有,韩一凡.红豆杉器官、组织、细胞培养和基因工程的研究进展[J].天然产物研究与开发,1998,10(1):90-98.
[55]邱德有,李如玉,韩一凡.紫杉醇提取分离方法的研究进展[J].中国药学杂志,1996,31(11):6-8.
[56]邱德有,朱微,朱至清.利用栝楼发根生产天花粉蛋白的研究[J].植物学报,1996,38(06):439-443+511.
[57]邱德有,黄美娟,方晓华,朱澂,朱至清.一种云南红豆杉内生真菌的分离[J].真菌学报,1994,13(04):314-316.
[58]邱德有,朱澂.植物的热激蛋白[J].植物生理学通讯,1994(02):139-142.
[59]邱德有,朱澂.植物抗渗透胁迫的基因调控及基因工程[J].生命科学,1993(04):16-17.
[60]邱德有, 1993, 利用转基因植物生产有用的次生代谢物质. 见:林金安.王宏良主编.植物科学综论. 哈尔滨:东北林业大学出版社, 20-34.
[61]邱德有.石刁柏育种进展[J].世界农业,1993(03):52-53.
[62]周维燕,邱德有,魏进华.石刁柏花粉胚的发生及纯合株的快速鉴定[J].北京农业大学学报,1992(04):369-374.
发表中文会议论文:
[1]刘敏,邱德有,晁慧娟,董清华. 利用反向PCR方法克隆草莓多酚氧化酶基因及基因两侧非编码序列[C]. 科技部863计划现代农业技术领域办公室.全国植物分子育种研讨会摘要集.科技部863计划现代农业技术领域办公室:中国作物学会,2009:32.
[2]刘敏,晁慧娟,邱德有,董清华. 草莓多酚氧化酶基因的克隆、反义表达载体构建及转化烟草的研究[C]. 科技部863计划现代农业技术领域办公室.全国植物分子育种研讨会摘要集.科技部863计划现代农业技术领域办公室:中国作物学会,2009:137.
[3]刘敏,滕文静,晁慧娟,董清华,邱德有. 草莓果实外源基因瞬时表达系统的建立[C]. 科技部863计划现代农业技术领域办公室.全国植物分子育种研讨会摘要集.科技部863计划现代农业技术领域办公室:中国作物学会,2009:138.
[4]李凤岚,马小军,邱德有. 曼地亚红豆杉细胞高效转基因体系的建立[C]. 科技部863计划现代农业技术领域办公室.全国植物分子育种研讨会摘要集.科技部863计划现代农业技术领域办公室:中国作物学会,2009:139.
[5]邱德有,韩一凡,李如玉. 东北红豆杉细胞培养的研究[C]. 中国林学会林木遗传育种分会、广西自治区林学会.面向21世纪的中国林木遗传育种——中国林学会林木遗传育种第四届年会文集.中国林学会林木遗传育种分会、广西自治区林学会:中国林学会林木遗传育种分会,1997:74.